تالاب انزلی منبع بازسازی ذخایر ماهیان مهاجردریای خزر نظیر سوف، ماهی سفید، سیاه کولی، شاه کولی، سیم ، کپور مهاجر، کولمه، ماش ماهی، ماهی آزاد وانواع خاویاری بوده و از طرفی نیز چراگاه و پرورشگاه ماهیان دریازی ومصبی دریای خزرنظیرکفال، برخی گاوماهیان، سوزن ماهی وگلآذین ماهی میباشد. همچنین این تالاب یکی از منابع مهم رهاسازی سالانه میلیونها قطعه بچه ماهی سفید، سوف سفید و ماهی سیم توسط سازمان شیلات ایران به منظور بازسازی ذخایر این ماهیان میباشد. در این تالاب گونه هایی از ماهیان غیربومی که اغلب مشکلاتی را نیز برای ماهیان بومی فراهم آورده اند، یافت میشود. با پیگیری های چند ساله پژوهشکده آبزی پروری آبهای داخلی و حمایت اداره کل محیط زیست استان گیلان پروژه ای تحت عنوان "بررسی وضعیت زیستی ماهیان تالاب انزلی و رودخانه های منتهی به آن" با هدف تعیین فهرست گونه های ماهیان و تعیین فراوانی نسبی آنها به تفکیک مناطق مختلف تالاب و رودخانه های وارده به آن و تعیین وضعیت زیستی گونه های ماهیان بومی و فهرست گونه های در معرض خطر طبق ضوابط اتحادیه بین المللی حفاظت از طبیعت و منابع طبیعی و راهکارهای احیای آنها در استان تصویب گردید که استانداری و سازمان مدیریت و برنامه ریزی گیلان پشتیبانی مادی آن را بعهده دارند.